Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP9

Vax2, Ventral anterior homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax2Q9WTP9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm35040-201ENSMUST00000206829 5094 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Vax2Q9WTP9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms