Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Prg3Q9JL95 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Prg3Q9JL95 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prg3Q9JL95 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prg3Q9JL95 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prg3Q9JL95 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Prg3Q9JL95 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Prg3Q9JL95 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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