Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hmgn5Q9JL35 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn5Q9JL35 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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