Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sall1Q9ER74 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms