Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Barx1Q9ER42 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms