Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Hmg20aQ9DC33 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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