Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ftsj3Q9DBE9 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ftsj3Q9DBE9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms