Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

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Length 389 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rsph3bQ9DA80 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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