Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop56Q9D6Z1 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop56Q9D6Z1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Nop56Q9D6Z1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop56Q9D6Z1 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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