Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rtl8cQ9D6I0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rtl8cQ9D6I0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms