Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Syce1Q9D495 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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