Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms