Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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Zbed3Q9D0L1 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Zbed3Q9D0L1 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms