Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ssbp2Q9CYZ8 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Ssbp2Q9CYZ8 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms