Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sgo1Q9CXH7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sgo1Q9CXH7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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