Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQG0

Tmed6, Transmembrane emp24 domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed6Q9CQG0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Tmed6Q9CQG0 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms