Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Atp6v0e1Q9CQD8 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
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