Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

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Length 373 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Cep41Q99NF3 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Clpb-211ENSMUST00000209579 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Cep41Q99NF3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Cep41Q99NF3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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