Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Mrpl27Q99N92 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms