Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm24830-201ENSMUST00000102024 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26232-201ENSMUST00000083360 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm24136-201ENSMUST00000083374 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Rnu1b6-201ENSMUST00000083839 166 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atp1b4Q99ME6 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms