Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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PtprtQ99M80 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
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PtprtQ99M80 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PtprtQ99M80 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
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