Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ciao1Q99KN2 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms