Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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Pacsin3Q99JB8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Pacsin3Q99JB8 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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