Protein–RNA interactions for Protein: Q91VB4

Hps3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,002 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps3Q91VB4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hps3Q91VB4 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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