Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS7

Cep57l1, Centrosomal protein CEP57L1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep57l1Q8VDS7 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Cep57l1Q8VDS7 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cep57l1Q8VDS7 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms