Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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