Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.02■□□□□ -0
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Ubxn4Q8VCH8 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ubxn4Q8VCH8 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ubxn4Q8VCH8 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ubxn4Q8VCH8 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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