Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
LgsnQ8CIX8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
LgsnQ8CIX8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms