Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Nup88Q8CEC0 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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