Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc17Q8CE13 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms