Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrif1Q8CDD9 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrif1Q8CDD9 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Lrif1Q8CDD9 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrif1Q8CDD9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms