Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S0

Usp44, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 44, mousemouse

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Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp44Q8C2S0 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Usp44Q8C2S0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Usp44Q8C2S0 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp44Q8C2S0 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Usp44Q8C2S0 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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