Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP99

UPF0500 protein C1orf216 homolog, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BP99 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Q8BP99 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8BP99 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Q8BP99 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Q8BP99 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q8BP99 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q8BP99 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms