Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMQ2

Gtf3c4, General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 817 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4Q8BMQ2 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gtf3c4Q8BMQ2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c4Q8BMQ2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms