Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Lrrtm2Q8BGA3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms