Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Ell3Q80VR2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms