Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
NischQ80TM9 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm8194-201ENSMUST00000159783 859 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NischQ80TM9 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms