Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
TwistnbQ78WZ7 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TwistnbQ78WZ7 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms