Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Usp49Q6P9L4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usp49Q6P9L4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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