Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Krt39Q6IFX4 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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