Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Col4a5Q63ZW6 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Col4a5Q63ZW6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms