Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sall3Q62255 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms