Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

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Length 824 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ift88Q61371 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ift88Q61371 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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