Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Foxd1Q61345 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Foxd1Q61345 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Foxd1Q61345 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Foxd1Q61345 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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