Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sim1Q61045 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sim1Q61045 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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