Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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JrkQ60976 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
JrkQ60976 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
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JrkQ60976 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
JrkQ60976 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms