Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Rbbp4Q60972 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms