Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sin3aQ60520 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms