Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

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Length 500 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ccdc85aQ5SP85 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ccdc85aQ5SP85 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ccdc85aQ5SP85 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Ccdc85aQ5SP85 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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