Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm10863-201ENSMUST00000130745 438 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trim41Q5NCC3 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms